Rivista
/
Genetica
/
Scoperta di romanzo sequenza genomica sottrattiva
JoVE Journal
Genetica
È necessario avere un abbonamento a JoVE per visualizzare questo.  Accedi o inizia la tua prova gratuita.
JoVE Journal Genetica
Novel Sequence Discovery by Subtractive Genomics
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

Scoperta di romanzo sequenza genomica sottrattiva

DOI:
10.3791/58877-v

•

09:40 min

•

January 25, 2019

•

, ,
1Biology Department,American University

Capitoli

  • 00:04Titolo
  • 01:08De novo Assemble Starting Sequence
  • 02:03BLAST the Assembly Against the Reference Sequence
  • 04:44Design Primers for the Sequence that Remains
  • 06:25qPCR Validation of the Remaining Sequence
  • 07:51Results: Example Data of qPCR Results Including Negative and Positive Outcomes
  • 08:53Conclusion

Summary

Traduzione automatica

Traduzione automatica

Lo scopo del presente protocollo è quello di utilizzare una combinazione di computazionale e panca ricerca per trovare nuove sequenze che non possono essere facilmente separate da una sequenza co-purificante, che può essere conosciuta solo parzialmente.

Tags

Keywords: Novel Sequence DiscoverySubtractive GenomicsGenomic SequencesInexpensiveFlexibleBacterial Vaccine TargetsVirus IdentificationUnknown SeparationReference SequenceTrimmomaticPearReptileTrinityBlastTransdeckorTblastn

Article

Embed

AGGIUNGI ALLA PLAYLIST

Usage Statistics

Video correlati

check_url/it/58877?article_type=v

In vitro trascrizione saggi e la loro applicazione in Drug Discovery
check_url/it/58877?article_type=v

Novel RNA-Proteine ​​leganti isolamento dalla rapida Metodologia
check_url/it/58877?article_type=v

Coniugazione saggi di accoppiamento per l'analisi specifica per sequenza di proteine ​​di trasferimento relativi coniugazione batterica
check_url/it/58877?article_type=v

Determinazione dei percorsi cromosomici ottimali per un elemento di DNA in Escherichia coli usando un approccio novello Transposon-mediata
check_url/it/58877?article_type=v

Dieta grassa alta alimentazione e Throughput elevato dosaggio di Triacylglyceride in Drosophila Melanogaster
check_url/it/58877?article_type=v

Riconoscimento di sequenza-specifico e selettivo di Double-stranded RNA sopra Single-stranded RNA da modificati chimicamente acidi peptido nucleici
check_url/it/58877?article_type=v

Informatica analisi dei dati di sequenza da Batch lievito ibrido 2 schermi
check_url/it/58877?article_type=v

Sequenziamento dell'mRNA da sangue intero utilizzando il sequenziamento di NanoPore
check_url/it/58877?article_type=v

Navigazione MARRVEL, uno strumento basato sul Web che integra la genomica umana e le informazioni di genetica degli organismi modello
check_url/it/58877?article_type=v

Esplorare lo spazio di sequenza per identificare i siti di legame per le proteine di legame dell'RNA regolamentare

Read Article