Rivista
/
Genetica
/
Romanserie upptäckten av subtraktiv genomik
JoVE Journal
Genetica
È necessario avere un abbonamento a JoVE per visualizzare questo.  Accedi o inizia la tua prova gratuita.
JoVE Journal Genetica
Novel Sequence Discovery by Subtractive Genomics
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

Romanserie upptäckten av subtraktiv genomik

DOI:
10.3791/58877-v

•

09:40 min

•

January 25, 2019

•

, ,
1Biology Department,American University

Capitoli

  • 00:04Titolo
  • 01:08De novo Assemble Starting Sequence
  • 02:03BLAST the Assembly Against the Reference Sequence
  • 04:44Design Primers for the Sequence that Remains
  • 06:25qPCR Validation of the Remaining Sequence
  • 07:51Results: Example Data of qPCR Results Including Negative and Positive Outcomes
  • 08:53Conclusion

Summary

Traduzione automatica

Traduzione automatica

Syftet med detta protokoll är att använda en kombination av computational och bänk forskning för att hitta nya sekvenser som inte kan lätt separeras från en co renande sekvens, som kan vara endast delvis kända.

Tags

Keywords: Novel Sequence DiscoverySubtractive GenomicsGenomic SequencesInexpensiveFlexibleBacterial Vaccine TargetsVirus IdentificationUnknown SeparationReference SequenceTrimmomaticPearReptileTrinityBlastTransdeckorTblastn

Article

Embed

AGGIUNGI ALLA PLAYLIST

Usage Statistics

Video correlati

check_url/it/58877?article_type=v

Transkription in vitro analyser och deras tillämpning i Drug Discovery
check_url/it/58877?article_type=v

Nya RNA-bindande proteiner Isolering av den snabba Methodology
check_url/it/58877?article_type=v

Konjugativ Parning Analyser för sekvensspecifik analys av Transfer proteiner involverade i konjugation
check_url/it/58877?article_type=v

Bestämning av optimala kromosomala belägenheten för ett DNA-Element i Escherichia coli använder en ny metod för Transposon-medierad
check_url/it/58877?article_type=v

High Fat Diet utfodring och hög genomströmning Triacylglyceride test på Drosophila Melanogaster
check_url/it/58877?article_type=v

Sekvens-specifika och selektiv erkännande av dubbelsträngat RNA över enkelsträngat RNA av kemiskt modifierade peptid nukleinsyror
check_url/it/58877?article_type=v

Datoriserad analys av sekvensdata från Batch jäst 2-Hybrid skärmar
check_url/it/58877?article_type=v

Sekvensering av mRNA från helblod med Nanopore sekvensering
check_url/it/58877?article_type=v

Navigera i MARRVEL, ett webbaserat verktyg som integrerar Human Genomics och Modellorganismens gen etik information
check_url/it/58877?article_type=v

Utforska Sekvensutrymme för att identifiera bindnings platser för regulatoriska RNA-bindande proteiner

Read Article