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Ultra-long Read Sequencing for Whole Genomic DNA Analysis
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Sequenziamento di lettura ultra-lungo per analisi di DNA Genomic intero

DOI:
10.3791/58954-v

•

10:34 min

•

March 15, 2019

•

, , , ,
1Genome Technologies,Jackson Laboratory for Genomic Medicine

Capitoli

  • 00:04Titolo
  • 01:24High-molecular Weight (HMW) DNA Extraction
  • 03:11Ultra-long DNA Library Construction – Mechanical Shearing-based Protocol
  • 05:19Ultra-long DNA Library Construction – Transposase Fragmentation-based Protocol
  • 06:23Sequencing on the Nanopore Device
  • 07:52Results: Ultra-long DNA Sequencing Protocol
  • 09:38Conclusion

Summary

Traduzione automatica

Traduzione automatica

Lungo-ha letto sequenze notevolmente facilitano l'assemblaggio di complessi genomi e caratterizzazione di variazione strutturale. Descriviamo un metodo per generare sequenze ultra-lunghi di piattaforme nanopore di sequenziamento. L'approccio adotta un'estrazione di DNA ottimizzata seguita da preparazioni di libreria modificata per generare centinaia di kilobase letture con moderata copertura da cellule umane.

Tags

Ultra-long Read SequencingWhole Genomic DNA AnalysisHigh-molecular Weight DNARepeat Expansion DisordersHLA-typingPrecision MedicineDNA ExtractionMechanical ShearingLibrary Preparation

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