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작은 분자 조사를 시험관 및 셀 모양을 사용 하 여 사전 mRNA 구조 변화 유도

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Genetica

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Using In Vitro and In-cell SHAPE to Investigate Small Molecule Induced Pre-mRNA Structural Changes

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작은 분자 조사를 시험관 및 셀 모양을 사용 하 여 사전 mRNA 구조 변화 유도

DOI:

10.3791/59021-v

•

11:58 min

•

January 30, 2019

•

Jingxin Wang, John Hammond, Kristen A. Johnson

¹Calibr,The Scripps Research Institute, ²Department of Integrative Structural and Computational Biology,The Scripps Research Institute

Capitoli

00:04Titolo
00:31³²P-labeled Primer Labeling for In Vitro Selective 2‘-hydroxyl Acylation Analyzed by Primer Extension (SHAPE)
03:44Small Molecule Binding and RNA 2‘-OH Modification
06:29Marker Preparation and Primer Extension
08:59PAGE Analysis
10:15Results of In Vitro and In-cell SHAPE for Analyzing Small Molecule Induced Pre-mRNA Structural Changes
11:02Conclusion

Summary

Traduzione automatica

둘 다 생체 외에서 그리고 세포에서 선택적 2'-히 드 록 acylation 뇌관 연장 (모양) 실험 사전 mRNA 시퀀스는 RNA를 대상으로 작은 분자의 존재의 2 차 구조를 결정 하 여 분석에 대 한 자세한 프로토콜은 이 문서에서 제시 하는.

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Keywords: In Vitro SHAPE In-cell SHAPE RNA Secondary Structure Small Molecule Pre-mRNA Reverse Transcription Radioactive Labeling Acrylamide Gel Passive Elution

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