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Transcription Start Site Mapping Using Super-low Input Carrier-CAGE
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Trascrizione Inizio mapping del sito utilizzando vettore-CAGE di input super-basso

DOI:
10.3791/59805-v

•

06:59 min

•

June 26, 2019

•

, ,
1Institute of Clinical Sciences, Faculty of Medicine,Imperial College London, 2MRC London Institute of Medical Sciences, 3Sars International Centre for Marine Molecular Biology,University of Bergen

Capitoli

  • 00:04Titolo
  • 01:04Preparation of DNA Templates
  • 01:38Reverse Transcription
  • 02:24Purification of cDNA:RNA Hybrids Using Magnetic Beads
  • 03:42Cap-trapping
  • 05:16Control of Degradation Level and Determination of the Number of PCR Cycles
  • 05:39Results: DNA Quality and Validation of SLIC-CAGE Libraries
  • 06:26Conclusion

Summary

Traduzione automatica

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Cap Analysis of Gene Expression (CAGE) è un metodo per la mappatura quantitativa a livello di genoma di mRNA 5'end per catturare i siti di inizio della trascrizione della polimerasi II dell'RNA a una risoluzione mononucleotide. Questo lavoro descrive un protocollo a basso input (SLIC-CAGE) per la generazione di librerie di alta qualità utilizzando quantità di nanogrammi di RNA totale.

Tags

Transcription Start Site MappingSLIC-CAGECarrier-CAGERNA Polymerase IIGene RegulationCore PromoterEnhancer DiscoveryDiagnostic MarkersEmbryonic DevelopmentReverse TranscriptionSPRI Magnetic Beads

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