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पौधों में माइक्रोआरएनए ट्रांसक्रिप्टोम का सटीक और कुशलता पूर्वक विश्लेषण करने के लिए एक बायोइन्फॉर्मेटिक्स पाइपलाइन
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A Bioinformatics Pipeline to Accurately and Efficiently Analyze the MicroRNA Transcriptomes in Plants
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पौधों में माइक्रोआरएनए ट्रांसक्रिप्टोम का सटीक और कुशलता पूर्वक विश्लेषण करने के लिए एक बायोइन्फॉर्मेटिक्स पाइपलाइन

DOI:
10.3791/59864-v

•

06:34 min

•

January 21, 2020

•

, , ,
1Beijing Key Laboratory of Agricultural Genetic Resources and Biotechnology, Beijing Agro-Biotechnology Research Center,Beijing Academy of Agriculture and Forestry Sciences, 2State Key Laboratory of Protein and Plant Gene Research, Peking-Tsinghua Center for Life Sciences, School of Advanced Agricultural Sciences and School of Life Sciences,Peking University

Capitoli

  • 00:04Titolo
  • 01:15Installation and Testing
  • 02:56Identifying Novel MicroRNAs (miRNAs)
  • 03:33Reference Index Building
  • 04:42Results: Representative miRDP2 Performance
  • 05:45Conclusion

Summary

Traduzione automatica

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अद्यतन संयंत्र मिरना मानदंड और एक ओवरहाल ्ड एल्गोरिदम के साथ एक बायोइन्फॉर्मेटिक्स पाइपलाइन, अर्थात् एमआईआरदीप-पी 2 (एमआईआरपी2), पौधों में माइक्रोआरएनए ट्रांसक्रिप्टोम का सही और कुशलता से विश्लेषण कर सकती है, विशेष रूप से जटिल और बड़े जीनोम वाली प्रजातियों के लिए।

Tags

Bioinformatics PipelineMicroRNA TranscriptomesPlantsMiRDeep2Plant MicroRNAsTranscriptional RegulatorsPlant DevelopmentEnvironmental ChallengesFalse PositivesProcessing TimeHigh Confidence MicroRNA AnnotationGenome FunctionMiRDeep2 PipelineArabidopsis ThalianaGenome Reference IndexNoncoding RNA Reference IndexDeep Sequencing ReadsAdaptersFASTA Identifiers

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