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Erkennung der Retrotranspositionsaktivität von Hot LINE-1s durch inverse Langstrecken-PCR
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Detection of Retrotransposition Activity of Hot LINE-1s by Long-Distance Inverse PCR
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Erkennung der Retrotranspositionsaktivität von Hot LINE-1s durch inverse Langstrecken-PCR

DOI:
10.3791/59880-v

•

10:54 min

•

July 27, 2019

•

,
1Systems Oncology Research Program,University of Helsinki, 2Department of Biochemistry and Developmental Biology, Medicum,University of Helsinki

Capitoli

  • 00:00Titolo
  • 01:41Designing Inverse Primers and Selecting Restriction Enzymes (Bioinformatics)
  • 05:56Making Circular DNA Templates for Long-distance Inverse PCR: DNA Extraction and Quality Assessment
  • 08:29Long-distance Inverse PCR: Determining Primer Annealing Temperature by Gradient PCR
  • 10:25Representative Results of LDI-PCR
  • 11:27Conclusion

Summary

Traduzione automatica

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Dieser Artikel beschreibt einen einfachen PCR-basierten Assay, um die Aktivität eines aktiven LINE-1-Retrotransposons zu überwachen und de novo Retrotranspositionen in einem bestimmten Genom abzubilden. Anhand der MCF7-Zelllinie zeigen wir hierin, wie diese Methode angewendet werden kann, um die Aktivität einer LINE-1 zu erkennen, die sich bei 22q12.1 befindet.

Tags

Keywords: LINE-1 RetrotranspositionInverse PCRGenomic InstabilityCancer BiomarkerTTC28 GenePolyadenylation SignalPrimer Design

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