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Migliorare il piccolo RNA-seq: meno Bias e migliore rilevamento di 2'-O-Methyl RNA

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Genetica

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Improving Small RNA-seq: Less Bias and Better Detection of 2′-O-Methyl RNAs

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Migliorare il piccolo RNA-seq: meno Bias e migliore rilevamento di 2'-O-Methyl RNA

DOI:

10.3791/60056-v

•

08:49 min

•

September 16, 2019

•

Erwin L. van Dijk, Evangelia Eleftheriou, Claude Thermes

¹Institute for Integrative Biology of the Cell, UMR9198, CNRS CEA Univ Paris-Sud,Université Paris-Saclay

Capitoli

00:04Titolo
00:33Small RNA Isolation
02:26Unligated 3’ Adapter Elimination
04:41Gel Purification
05:27Raw Sequence File Treatment
06:06Trimmed Sequence Mapping
06:58Results: Representative 2’-OMe RNA Detection
08:18Conclusion

Summary

Traduzione automatica

Vi presentiamo un piccolo protocollo di riparazione della libreria di RNA dettagliato con meno distorsione rispetto ai metodi standard e una maggiore sensibilità per 2'-O-metilRNA. Questo protocollo può essere seguito utilizzando reagenti fatti in casa per risparmiare sui costi o utilizzando kit per comodità.

Tags

Small RNA-seq RNA Detection 2′-O-Methyl RNAs Unbiased Methods Plant MicroRNAs Gel Electrophoresis RNA Extraction Adapter Elimination Magnetic Purification Beads

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