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Mejora de ARN pequeño-seq: Menos sesgo y mejor detección de 2'-O-Metil RNAs

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Genetica

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Improving Small RNA-seq: Less Bias and Better Detection of 2′-O-Methyl RNAs

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Mejora de ARN pequeño-seq: Menos sesgo y mejor detección de 2'-O-Metil RNAs

DOI:

10.3791/60056-v

•

08:49 min

•

September 16, 2019

•

Erwin L. van Dijk, Evangelia Eleftheriou, Claude Thermes

¹Institute for Integrative Biology of the Cell, UMR9198, CNRS CEA Univ Paris-Sud,Université Paris-Saclay

Capitoli

00:04Titolo
00:33Small RNA Isolation
02:26Unligated 3’ Adapter Elimination
04:41Gel Purification
05:27Raw Sequence File Treatment
06:06Trimmed Sequence Mapping
06:58Results: Representative 2’-OMe RNA Detection
08:18Conclusion

Summary

Traduzione automatica

Presentamos un protocolo detallado de reparación de la biblioteca de ARN pequeño con menos sesgo que los métodos estándar y una mayor sensibilidad para los ARN de 2'-O-metil. Este protocolo se puede seguir utilizando reactivos caseros para ahorrar costos o usar kits para mayor comodidad.

Tags

Small RNA-seq RNA Detection 2′-O-Methyl RNAs Unbiased Methods Plant MicroRNAs Gel Electrophoresis RNA Extraction Adapter Elimination Magnetic Purification Beads

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