Rivista
/
Genetica
/
Kartlägga Alzheimers sjukdom varianter till sina målgener med hjälp av Computational analys av kromatin konfiguration
JoVE Journal
Genetica
This content is Free Access.
JoVE Journal Genetica
Mapping Alzheimer’s Disease Variants to Their Target Genes Using Computational Analysis of Chromatin Configuration
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

Kartlägga Alzheimers sjukdom varianter till sina målgener med hjälp av Computational analys av kromatin konfiguration

DOI:
10.3791/60428-v

•

04:41 min

•

January 09, 2020

•

, , ,
1Department of Genetics,University of North Carolina, 2Neuroscience Center,University of North Carolina, 3Thurston Arthritis Research Center,University of North Carolina, 4Department of Cell Biology and Physiology,University of North Carolina

Capitoli

  • 00:05Titolo
  • 01:00Generation of a Granges Object for Credible SNPs and Positional Mapping
  • 01:53Developmental Expression Trajectories
  • 02:18Cell-type Expression Profiles and Gene Annotation Enrichment Analysis
  • 02:46Results: Determination and Characterization of Putative Target Genes of AD GWS Loci
  • 03:52Conclusion

Summary

Traduzione automatica

Traduzione automatica

Vi presenterar ett protokoll för att identifiera funktionella implikationer av icke-kodningsvarianter identifierade genom genomomfattande Associations studier (GWAS) med hjälp av tredimensionella kromatininteraktioner.

Tags

Alzheimer’s DiseaseGWASChromatin ConfigurationComputational AnalysisTarget GenesSNPsHi-CGene ExpressionCell-type ExpressionGene Annotation Enrichment

Article

Embed

AGGIUNGI ALLA PLAYLIST

Usage Statistics

Video correlati

Kartläggning av RNA-RNA-interaktioner globalt med användning av biotinylerad psoralen

Sekventiell Salt extraktioner för analys av Bulk kromatin bindande egenskaper av kromatin ändra komplex

Analys av c-KIT-ligand-promotorn med användning av kromatinimmunfällning

Retroviral Scanning: Kartläggning av MLV-integrationswebbplatser för att definiera cellspecifika reglerande regioner

Mappning av Genome-wide tillgängliga kromatin i primära humana T-lymfocyter av ATAC-Seq

Immunfärgning för DNA ändringar: tillämpad analys av Confocal bilder

Med Sniper-Cas9 att minimera Off-target effekter av CRISPR-Cas9 utan förlust av på målet aktiviteten Via riktad Evolution

Ett in vitro-protokoll för utvärdering av mikroRNA nivåer, funktioner och associerade målgener i tumörceller

In vivo funktionell studie av sjukdomsassocierade sällsynta humana varianter med hjälp av Drosophila

Identifiering av cirkulär RNAs med RNA-sekvensering

Read Article