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Analisando fatores de expressão gênica do tumor com o portal da Web CorExplorer
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JoVE Journal Ricerca sul cancro
Analyzing Tumor Gene Expression Factors with the CorExplorer Web Portal

Analisando fatores de expressão gênica do tumor com o portal da Web CorExplorer

DOI:
10.3791/60431-v

•

08:00 min

•

October 11, 2019

•

, ,
1Lyrid LLC, 2Independent consultant, 3Information Sciences Institute,University of Southern California

Capitoli

  • 00:04Titolo
  • 00:41Exploring Factors Containing a Gene of Interest
  • 03:06Filtering and Interpreting CorEx Factors and Finding Commonalities and Differences of Gene Expression Variation Across Tumor Types
  • 05:49Results: Representative Tumor Gene Expression Factor Analysis
  • 07:31Conclusion

Summary

Traduzione automatica

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Apresentamos o portal Web CorExplorer, um recurso para a exploração de fatores de sequenciamento de RNA tumoral encontrados pelo algoritmo de aprendizado de máquina CorEx (explicação de correlação), e mostrar como os fatores podem ser analisados em relação à sobrevivência, anotações de banco de dados, interações proteína-proteína, e um outro para ganhar a introspecção na biologia do tumor e em intervenções terapêuticas.

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CorExplorerTumor Gene ExpressionInformation MaximizationLatent FactorsCancer BiologyTCGALung CancerRNA SequencingFactor GraphGene ExpressionBiological DiscoveryGene-factor Associations

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