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Convalida del sequenziamento dei nanopore dell'intero genoma, usando Usutu Virus come esempio
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Validating Whole Genome Nanopore Sequencing, using Usutu Virus as an Example
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Convalida del sequenziamento dei nanopore dell'intero genoma, usando Usutu Virus come esempio

DOI:
10.3791/60906-v

•

05:45 min

•

March 11, 2020

•

, , ,
1ErasmusMC, Department of Viroscience, WHO Collaborating Centre for Arbovirus and Viral Hemorrhagic Fever Reference and Research,Erasmus University Medical Center

Capitoli

  • 00:04Introduction
  • 00:59Nanopore Data Consensus Sequence Generation
  • 02:33Nanopore Sequencing Error Profile Compensation
  • 03:54Results: Representative Nanopore Sequencing Error Rate Overview
  • 04:58Conclusion

Summary

Traduzione automatica

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In precedenza abbiamo convalidato un protocollo per il sequenziamento del virus USsutu intero genoma basato sull'amplicon (USUV) su una piattaforma di sequenziamento nanoporo. Qui, descriviamo i metodi utilizzati in modo più dettagliato e determiniamo il tasso di errore della cella di flusso nanopora R10.

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Artificial IntelligenceAI Writing AssistantsCopywritingContent GenerationText-based ContentContent CreationAI-assisted WritingWriter’s BlockContent EfficiencyReal-time SequencingVirus Genetic SequencingNanopore SequencingUsutu VirusError RateRead CoverageSequence DataConsensus SequenceReference-based AlignmentMinimap2SamtoolsKMA

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