Rivista
/
Genetica
/
Identifikation af forstærker-promotor kontakter i embryolede organer ved kvantitative kromosom kropsbygning Capture (4C)
JoVE Journal
Genetica
This content is Free Access.
JoVE Journal Genetica
Identification of Enhancer-Promoter Contacts in Embryoid Bodies by Quantitative Chromosome Conformation Capture (4C)

Identifikation af forstærker-promotor kontakter i embryolede organer ved kvantitative kromosom kropsbygning Capture (4C)

DOI:
10.3791/60960-v

•

10:02 min

•

April 29, 2020

•

, , ,
1Center for Genomic Regulation (CRG),The Barcelona Institute of Science and Technology, 2Universitat Pompeu Fabra, 3Vall d’Hebron Institute of Oncology

Capitoli

  • 00:04Introduction
  • 00:42Embyroid Body Generation
  • 02:51Dissociation of EBs
  • 03:48Fixation
  • 04:21Cell Lysis
  • 05:03Restriction Enzyme Digestion
  • 06:34DNA Shearing and Size Selection
  • 07:31Results: Enhance-Promoter Contacts During EB Differentiation
  • 09:13Conclusion

Summary

Traduzione automatica

Traduzione automatica

Vi rapporterer om anvendelsen af kvantitativ kromosomkropsformation efterfulgt af sekvensering med høj gennemløb i embryoide kroppe, der stammer fra embryonale stamceller. Denne teknik gør det muligt at identificere og koronere kontakterne mellem formodede smagsforstærkere og promotorregioner for et givet gen under embryonal stamcelledifferentiering.

Tags

4CChromosome Conformation CaptureEnhancer-promoter ContactsEmbryoid BodiesMouse Embryonic Stem CellsGene RegulationCis-regulatory ElementsChromatin InteractionsCell CultureCell Differentiation

Article

Embed

AGGIUNGI ALLA PLAYLIST

Usage Statistics

Video correlati

check_url/it/60960?article_type=v&slug=identification-enhancer-promoter-contacts-embryoid-bodies

Fremskyndet stråling Biodosimetry automatiseret ved Dicentric kromosom identifikation (ADCI) og dosis estimering
check_url/it/60960?article_type=v&slug=identification-enhancer-promoter-contacts-embryoid-bodies

Generation af Genome-wide kromatin kropsbygning Capture biblioteker fra stramt iscenesatte tidlige Drosophila embryoner
check_url/it/60960?article_type=v&slug=identification-enhancer-promoter-contacts-embryoid-bodies

Høj overførselshastighed identifikation af synergistiske Drug kombinationer af overlapning2 metode
check_url/it/60960?article_type=v&slug=identification-enhancer-promoter-contacts-embryoid-bodies

Høj overførselshastighed identifikation af regulerende gensekvenser ved hjælp af næste generations sekventering af cirkulære kromosom kropsbygning Capture (4C-seq)
check_url/it/60960?article_type=v&slug=identification-enhancer-promoter-contacts-embryoid-bodies

Identifikation af fodspor af RNA: protein komplekser via RNA Immunopræcipitation i tandem efterfulgt af sekventering (RIPiT-SEQ)
check_url/it/60960?article_type=v&slug=identification-enhancer-promoter-contacts-embryoid-bodies

Undersøgelse af den transkriptionelle rolle af en RUNX1 intronic LYDDÆMPER af crispr/Cas9 ribonucleoprotein i akutte myeloid leukæmiceller
check_url/it/60960?article_type=v&slug=identification-enhancer-promoter-contacts-embryoid-bodies

Identifikation af værts veje, som er målrettet mod bakterielle Effector-proteiner ved hjælp af gær toksicitet og suppressor skærme
check_url/it/60960?article_type=v&slug=identification-enhancer-promoter-contacts-embryoid-bodies

Forberedelse af meiotiske kromosomspreads fra zebrafisk spermatocytter
check_url/it/60960?article_type=v&slug=identification-enhancer-promoter-contacts-embryoid-bodies

Inducerende Hairy Roots af Agrobacterium rhizogenes-MedieretTransformation i Tartary Boghvede (Fagopyrum tataricum)
check_url/it/60960?article_type=v&slug=identification-enhancer-promoter-contacts-embryoid-bodies

Kromosomscreening af humane præimplantationsembryoner ved hjælp af brugt dyrkningsmedium: prøveindsamling og kromosomal ploidianalyse

Read Article