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定量染色体立体構造捕捉による胚体におけるエンハンサー・プロモーター接触の同定(4C)

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Genetica

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Identification of Enhancer-Promoter Contacts in Embryoid Bodies by Quantitative Chromosome Conformation Capture (4C)

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定量染色体立体構造捕捉による胚体におけるエンハンサー・プロモーター接触の同定(4C)

DOI:

10.3791/60960-v

•

10:02 min

•

April 29, 2020

•

Tian V. Tian^2,3, Enrique Vidal², Thomas Graf², Grégoire Stik²

¹Center for Genomic Regulation (CRG),The Barcelona Institute of Science and Technology, ²Universitat Pompeu Fabra, ³Vall d’Hebron Institute of Oncology

Capitoli

00:04Introduction
00:42Embyroid Body Generation
02:51Dissociation of EBs
03:48Fixation
04:21Cell Lysis
05:03Restriction Enzyme Digestion
06:34DNA Shearing and Size Selection
07:31Results: Enhance-Promoter Contacts During EB Differentiation
09:13Conclusion

Summary

Traduzione automatica

我々は、胚性幹細胞から生成された胚体における高スループットシーケンシングに続く定量染色体立体構造捕捉の適用を報告する。この技術は、胚性幹細胞分化中に所定の遺伝子の推定エンハンサーとプロモーター領域との接触を同定し、定量することを可能にする。

Tags

4C Chromosome Conformation Capture Enhancer-promoter Contacts Embryoid Bodies Mouse Embryonic Stem Cells Gene Regulation Cis-regulatory Elements Chromatin Interactions Cell Culture Cell Differentiation

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