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Fenotipagem de tensão de levedura de alta produtividade com sequenciamento de RNA baseado em gotículas
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1Department of Bioengineering and Therapeutic Sciences,University of California San Francisco, 2University of California Berkeley-UCSF Graduate Program in Bioengineering,University of California San Francisco, 3Department of Pharmaceutical Chemistry,University of California San Francisco, 4California Institute for Quantitative Biosciences,University of California San Francisco, 5Chan Zuckerberg Biohub
Capitoli
- 00:04Introduction
- 00:29Yeast Encapsulation in Hydrogels Using Device A
- 01:39Breaking and Washing Hydrogels
- 02:58Yeast Colony Lysis
- 04:04mRNA Capture Using Device B
- 05:27Results: High-Throughput Screening of C. albicans
- 07:24Conclusion
Um gargalo no ciclo de "projeto-construção-teste" da engenharia microbiana é a velocidade com que podemos executar telas funcionais de cepas. Descrevemos um método de alto throughput para triagem de cepas aplicado a centenas a milhares de células de levedura por experimento que utiliza sequenciamento de RNA baseado em gotículas.
