Rivista
/
/
Het ontcijferen van de structurele effecten van het activeren van EGFR-somatische mutaties met moleculaire dynamicasimulatie
JoVE Journal
Biochimica
This content is Free Access.
JoVE Journal Biochimica
Deciphering the Structural Effects of Activating EGFR Somatic Mutations with Molecular Dynamics Simulation
DOI:

15:05 min

May 20, 2020

, , ,

Capitoli

  • 00:04Introduction
  • 00:47Structure Preparation
  • 04:12System Setup
  • 05:17Molecular Dynamics Simulation
  • 07:15Visual Inspection Analysis
  • 08:29Root-Mean Square Deviation (RMSD) and Root-Mean Square Fluctuation (RMSF) Analysis
  • 09:58Hydrogen Bond Analysis
  • 10:57Free Energy Calculations
  • 12:25Representative Results: Molecular Dynamics Simulation of EGFR Somatic Mutations
  • 14:23Conclusion

Summary

Traduzione automatica

Het doel van dit protocol is om moleculaire dynamica simulaties te gebruiken om de dynamische structurele veranderingen die optreden als gevolg van activerende mutaties van het EGFR kinase eiwit te onderzoeken.

Video correlati

Read Article