Rivista
/
/
פענוח ההשפעות המבניות של הפעלת מוטציות סומטיות EGFR עם סימולציה דינמיקה מולקולרית
JoVE Journal
Biochimica
This content is Free Access.
JoVE Journal Biochimica
Deciphering the Structural Effects of Activating EGFR Somatic Mutations with Molecular Dynamics Simulation
DOI:

15:05 min

May 20, 2020

, , ,

Capitoli

  • 00:04Introduction
  • 00:47Structure Preparation
  • 04:12System Setup
  • 05:17Molecular Dynamics Simulation
  • 07:15Visual Inspection Analysis
  • 08:29Root-Mean Square Deviation (RMSD) and Root-Mean Square Fluctuation (RMSF) Analysis
  • 09:58Hydrogen Bond Analysis
  • 10:57Free Energy Calculations
  • 12:25Representative Results: Molecular Dynamics Simulation of EGFR Somatic Mutations
  • 14:23Conclusion

Summary

Traduzione automatica

מטרת הפרוטוקול היא להשתמש בסימולציות דינמיקה מולקולרית כדי לבחון את השינויים המבניים הדינמיים המתרחשים עקב הפעלת מוטציות של חלבון קינאז EGFR.

Video correlati

Read Article