Rivista
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आणविक गतिशीलता सिमुलेशन के साथ ईजीएफआर दैमेटिक म्यूटेशन को सक्रिय करने के संरचनात्मक प्रभावों को समझने
JoVE Journal
Biochimica
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JoVE Journal Biochimica
Deciphering the Structural Effects of Activating EGFR Somatic Mutations with Molecular Dynamics Simulation
DOI:

15:05 min

May 20, 2020

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Capitoli

  • 00:04Introduction
  • 00:47Structure Preparation
  • 04:12System Setup
  • 05:17Molecular Dynamics Simulation
  • 07:15Visual Inspection Analysis
  • 08:29Root-Mean Square Deviation (RMSD) and Root-Mean Square Fluctuation (RMSF) Analysis
  • 09:58Hydrogen Bond Analysis
  • 10:57Free Energy Calculations
  • 12:25Representative Results: Molecular Dynamics Simulation of EGFR Somatic Mutations
  • 14:23Conclusion

Summary

Traduzione automatica

इस प्रोटोकॉल का उद्देश्य ईजीएफआर किनेज़ प्रोटीन के उत्परिवर्तन को सक्रिय करने के कारण होने वाले गतिशील संरचनात्मक परिवर्तनों की जांच करने के लिए आणविक गतिशीलता सिमुलेशन का उपयोग करना है।

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