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代谢通路信息 GWAS 分析的路径关联研究工具
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A Pathway Association Study Tool for GWAS Analyses of Metabolic Pathway Information
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代谢通路信息 GWAS 分析的路径关联研究工具

DOI:
10.3791/61268-v

•

05:01 min

•

July 01, 2020

•

,
1Institute for Genomics, Biocomputing & Biotechnology,Mississippi State University, 2Corn Host Plant Resistance Research Unit,USDA-ARS

Capitoli

  • 00:05Introduction
  • 00:32Genome-Wide Association Study (GWAS) Data Loading
  • 00:57Load Linkage Disequilibrium (LD) Data Loading
  • 01:26Single Nucleotide Polymorphism (SNP) Assignment
  • 01:56Significant Pathway Discovery
  • 02:35Rugplot Visualization
  • 03:21Results: Representative GWAS Analyses of Metabolic Pathway Information
  • 04:21Conclusion

Summary

Traduzione automatica

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通过运行路径关联研究工具 （PAST），无论是通过闪亮应用还是通过 R 控制台，研究人员可以通过调查所涉及的代谢途径，更深入地了解其全基因组关联研究 （GWAS） 结果的生物学意义。

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GWASGenome-wide Association AnalysisMetabolic PathwayPASTPathway Association Study ToolSNPsLinkage DisequilibriumGene AnnotationPathway AnalysisRug PlotsR ConsoleShiny

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