यह प्रोटोकॉल क्लैमाइडिया ट्रेकोमेटिसके विकासात्मक म्यूटेंट की पहचान करने और उन्हें अलग करने के लिए एक निर्देशित आगे आनुवंशिक दृष्टिकोण में फ्लोरोसेंट प्रमोटर-रिपोर्टर्स, लाइव-सेल माइक्रोस्कोपी, और व्यक्तिगत समावेशन निष्कर्षण का उपयोग करता है।