Rivista
/
Chimica
/
Анализ расплавов и жидкостей из моделирования молекулярной динамики Ab Initio с помощью пакета UMD
JoVE Journal
Chimica
This content is Free Access.
JoVE Journal Chimica
Analyzing Melts and Fluids from Ab Initio Molecular Dynamics Simulations with the UMD Package
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

Анализ расплавов и жидкостей из моделирования молекулярной динамики Ab Initio с помощью пакета UMD

DOI:
10.3791/61534-v

•

06:37 min

•

September 17, 2021

•

, , , , ,
1Ecole Normale Supérieure de Lyon, Laboratory of Geology of Lyon UMR5276,CNRS, 2Centre for Earth Evolution and Dynamics (CEED),University of Oslo, 3CEA, DAM, DIF

Capitoli

  • 00:05Introduction
  • 00:24Analysis of the Molecular-dynamics Runs
  • 01:15Perform the Structural Analysis
  • 02:05Perform the Speciation Analysis
  • 02:51Compute Diffusion Coefficients
  • 03:27Time Correlation Functions
  • 04:04Thermodynamic Parameters Stemming from the Simulations
  • 04:29Results: Lifetime of the Si-O Chemical Species
  • 05:59Conclusion

Summary

Traduzione automatica

Traduzione automatica

Расплавы и жидкости являются вездесущими векторами массового переноса в природных системах. Мы разработали пакет с открытым исходным кодом для анализа ab initio молекулярно-динамического моделирования таких систем. Мы вычисляем структурные (связывание, кластеризация, химическое видообразование), перенос (диффузия, вязкость) и термодинамические свойства (вибрационный спектр).

Tags

Keywords: Ab Initio Molecular DynamicsUMD PackagePhysical PropertiesChemical PropertiesFluidsPython ScriptsMD SimulationVASPPair Distribution FunctionInteratomic Bond DistancesCoordination PolyhedraPolymerizationMean Square DisplacementSelf-diffusivityDiffusion Coefficients

Article

Embed

AGGIUNGI ALLA PLAYLIST

Usage Statistics

Video correlati

check_url/it/61534?article_type=v

Выделение и химическая характеристика липида А из грамотрицательных бактерий
check_url/it/61534?article_type=v

Анализируя Динамика белков с использованием водорода валютный масс-спектрометрии
check_url/it/61534?article_type=v

Визуализация Lignification динамика в растениях с нажмите химия: двойная маркировка, БЛАЖЕНСТВО!
check_url/it/61534?article_type=v

Химия горения топлива: количественные видообразования данные, полученные из атмосферы высокой температуры потока реактора с сочетании молекулярно лучевой масс-спектрометр
check_url/it/61534?article_type=v

Проверка структуры и динамики межфазного воды с сканирование туннелирования микроскопии и спектроскопии
check_url/it/61534?article_type=v

Закрытого типа беспроводных Нанопор электрод для анализа одного наночастиц
check_url/it/61534?article_type=v

Мультимасштабный выборки гетерогенных воды/металла катализатора интерфейса с использованием теории функционала плотности и Force-Field молекулярной динамики
check_url/it/61534?article_type=v

Разработка гибридов Фотосенсибилизатора-Кобалоксима для производства H2 на солнечной энергии в aqueous аэробных условиях
check_url/it/61534?article_type=v

Вибрационная спектра N719-Хромофор/Титания Интерфейс от Эмпирического-Потенциального Молекулябельно-динамического моделирования, соваренного ионной жидкостью комнатной температуры

Вычисление атмосферных концентраций молекулярных кластеров из термохимии ab initio

Read Article