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Generieren von Transposon-Einfügungsbibliotheken in gramnegativen Bakterien für die Sequenzierung mit hohem Durchsatz
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Generating Transposon Insertion Libraries in Gram-Negative Bacteria for High-Throughput Sequencing
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Generieren von Transposon-Einfügungsbibliotheken in gramnegativen Bakterien für die Sequenzierung mit hohem Durchsatz

DOI:
10.3791/61612-v

•

08:19 min

•

July 07, 2020

•

, ,
1Department of Biology,University of Texas at Arlington

Capitoli

  • 00:04Introduction
  • 00:57Bacterial Mating
  • 02:47Generation of Final Bacterial Mutant Library
  • 04:11DNA Shearing and Poly-C Tail Addition
  • 06:23Results: Transposon Mutant Library
  • 07:31Conclusion

Summary

Traduzione automatica

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Wir beschreiben eine Methode zur Generierung von sättigungsverstärkenden Mutationsbibliotheken in gramnegativen Bakterien und der anschließenden Herstellung von DNA-Amplikonbibliotheken für die Sequenzierung mit hohem Durchsatz. Als Beispiel konzentrieren wir uns auf den ESKAPE-Erreger Acinetobacter baumannii, aber dieses Protokoll ist für eine Vielzahl von Gram-negativen Organismen zugänglich.

Tags

Transposon Insertion LibraryGram-negative BacteriaHigh-throughput SequencingEssential GenesAntibiotic ResistanceIn Vivo FitnessMechanical ShearingPoly-CTLRestriction EnzymesAdapter LigationBacterial GeneticsGenotype-phenotype RelationshipsMatingDiaminopimelic AcidGlycerolFrozen Stock

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