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Immunologia e infezioni
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JoVE Journal Immunologia e infezioni
T and B Cell Receptor Immune Repertoire Analysis using Next-generation Sequencing
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T- und B-Zell-Rezeptor-Immunrepertoireanalyse mittels Next-Generation-Sequencing

DOI:
10.3791/61792-v

•

08:59 min

•

January 12, 2021

•

, , , ,
1Pediatric Gastroenterology Unit, Edmond and Lily Safra Children’s Hospital,Sheba Medical Center, 2Sackler Faculty of Medicine,Tel Aviv University, 3Cancer Research Center,Sheba Medical Center, 4Molecular Hematology Laboratory,Sheba Medical Center

Capitoli

  • 00:05Introduction
  • 00:48DNA Isolation and Library Preparation
  • 04:21Amplicon Purification and Quantification
  • 05:57Next-generation Sequencing
  • 06:57Results: TCRβ and IGH Immune Repertoire Data Analysis
  • 08:27Conclusion

Summary

Traduzione automatica

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Das aktuelle Protokoll beschreibt eine Methode zur DNA-Isolierung aus Blutproben und Darmbiopsien, die Generierung von TCRβ- und IGH-PCR-Bibliotheken für die Sequenzierung der nächsten Generation, die Durchführung eines NGS-Laufs und die grundlegende Datenanalyse.

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Keywords: T Cell ReceptorB Cell ReceptorNext-generation SequencingLymphocyte DiversityBiomarkersDNA IsolationCell LysisProteinase KProtein PrecipitationDNA Extraction

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