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Flusso di lavoro di proteomica quantitativa utilizzando il rilevamento basato sul monitoraggio di reazioni multiple di proteine dal tessuto cerebrale umano
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Quantitative Proteomics Workflow using Multiple Reaction Monitoring Based Detection of Proteins from Human Brain Tissue
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Flusso di lavoro di proteomica quantitativa utilizzando il rilevamento basato sul monitoraggio di reazioni multiple di proteine dal tessuto cerebrale umano

DOI:
10.3791/61833-v

•

11:49 min

•

August 28, 2021

•

, ,
1Centre for Research in Nanotechnology and Science,Indian Institute of Technology Bombay, 2Department of Biosciences and Bioengineering,Indian Institute of Technology Bombay

Capitoli

  • 00:05Introduction
  • 00:49Protein Extraction from Brain Tissue
  • 02:04Protein Quantification and Quality Check
  • 02:32Protein Digestion
  • 03:58Desalting and Peptide Quantification
  • 05:06Transition List Preparation of Finalised Targets
  • 07:30LC Parameters
  • 08:03MS Parameters
  • 08:25Run Sequence and Instrument QC
  • 09:08Method Refinement
  • 10:58Results and Conclusions

Summary

Traduzione automatica

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Il protocollo mira a introdurre l'uso di uno spettrometro di massa a triplo quadrupolo per il monitoraggio a reazione multipla (MRM) di proteine provenienti da campioni clinici. Abbiamo fornito un flusso di lavoro sistematico a partire dalla preparazione dei campioni all'analisi dei dati per i campioni clinici con tutte le precauzioni necessarie da prendere.

Tags

Keywords: Quantitative ProteomicsMultiple Reaction MonitoringTargeted ProteomicsProtein DetectionSample PreparationProtein ExtractionProtein DigestionPeptide CleanupMass Spectrometry

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