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カーブレット変換ベースのツールを使用したフィブリラーコラーゲンの定量化

JoVE Journal
Bioingegneria

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Quantifying Fibrillar Collagen Organization with Curvelet Transform-Based Tools

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カーブレット変換ベースのツールを使用したフィブリラーコラーゲンの定量化

DOI:

10.3791/61931-v

•

07:58 min

•

November 11, 2020

•

Yuming Liu, Kevin W. Eliceiri^2,3

¹Laboratory for Optical and Computational Instrumentation, Center for Quantitative Cell Imaging,University of Wisconsin-Madison, ²Departments of Medical Physics and Biomedical Engineering,University of Wisconsin-Madison, ³Morgridge Institute for Research, Madison, Wisconsin, ⁴test,test

Capitoli

00:04Introduction
00:43CT-FIRE Fiber Extraction and Region of Interest (ROI) Analysis
02:34Advanced CT-FIRE Post-Processing
04:09CurveAlign Fiber Analysis: CT Mode Without Boundary
05:03CurveAlign Fiber Analysis: CT-FIRE Mode with Boundary
06:14CurveAlign Region of Interest (ROI) Analysis
06:56Results: Representative Tumor-Associated Human Breast Cancer Tissue Microarray (TMA) Collagen Signatures
07:26Conclusion

Summary

Traduzione automatica

ここでは、正常組織と疾患組織の両方の細胞外マトリックスでフィブリラーコラーゲン組織を定量化するための曲線変換ベースのオープンソースMATLABソフトウェアツールを使用するプロトコルを提示する。このツールは、コラーゲン繊維や他の種類の線状の構造を持つ画像に適用することができます。

Tags

Keywords: Fibrillar Collagen Collagen Organization Extracellular Matrix Curvelet Transform CT-FIRE Image Analysis Fiber Extraction Region Of Interest Post-processing

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