Genom att kombinera DNA-halopreparat med fluorescens in situ-hybridisering möjliggörs högupplöst analys av genomiska interaktioner med nukleoskelettet. Bifogat genom leder till hybridiserade fluorescerande signaler belägna inom de kvarvarande extraherade kärnorna, medan icke-bundet genom ligger i DNA-halo som omger restkärnorna.