JoVE
JoVE
Sportello unico per docenti
Ricerca
Comportamento
Biochimica
Biologia
Bioingegneria
Ricerca sul cancro
Chimica
Biologia dello sviluppo
Ingegneria
Ambiente
Genetica
Immunologia e infezioni
Medicina
Neuroscienze
JoVE Journal
Enciclopedia JoVE degli Esperimenti
JoVE Chrome Extension
Didattica
Biologia
Chimica
Clinical
Ingegneria
Scienze ambientali
Pharmacology
Fisica
Psicologia
Statistica
JoVE Core
JoVE Educazione Scientific
Manuale di laboratorio JoVE
JoVE Quiz
JoVE Business
Videos Mapped to your Course
Autori
Personale delle biblioteche
Scuole superiori
Chi siamo
Sign-In
Accedi
Contattaci
Ricerca
JoVE Journal
Enciclopedia JoVE degli Esperimenti
Didattica
JoVE Core
JoVE Educazione Scientific
Manuale di laboratorio JoVE
Scuole superiori
IT
EN - English
CN - 中文
DE - Deutsch
ES - Español
KR - 한국어
IT - Italiano
FR - Français
PT - Português
IT
EN - English
CN - 中文
DE - Deutsch
ES - Español
KR - 한국어
IT - Italiano
FR - Français
PT - Português
Close
Ricerca
Comportamento
Biochimica
Bioingegneria
Biologia
Ricerca sul cancro
Chimica
Biologia dello sviluppo
Ingegneria
Ambiente
Genetica
Immunologia e infezioni
Medicina
Neuroscienze
Products
JoVE Journal
Enciclopedia JoVE degli Esperimenti
Didattica
Biologia
Chimica
Clinical
Ingegneria
Scienze ambientali
Pharmacology
Fisica
Psicologia
Statistica
Products
JoVE Core
JoVE Educazione Scientific
Manuale di laboratorio JoVE
JoVE Quiz
JoVE Business
Video consigliati per il tuo insegnamento
Teacher Resources
Get in Touch
Instant Trial
Log In
IT
EN - English
CN - 中文
DE - Deutsch
ES - Español
KR - 한국어
IT - Italiano
FR - Français
PT - Português
Rivista
/
Ricerca sul cancro
/
שלוש שיטות לניתוח ביטויים דיפרנציאליים לרצף RNA: לימה, EdgeR, DESeq2
JoVE Journal
Ricerca sul cancro
Author Produced
È necessario avere un abbonamento a JoVE per visualizzare questo.
Accedi o inizia la tua prova gratuita.
JoVE Journal
Ricerca sul cancro
Three Differential Expression Analysis Methods for RNA Sequencing: limma, EdgeR, DESeq2
Please note that all translations are automatically generated.
Click here for the English version.
שלוש שיטות לניתוח ביטויים דיפרנציאליים לרצף RNA: לימה, EdgeR, DESeq2
DOI:
10.3791/62528-v
•
10:10 min
•
September 18, 2021
•
Shiyi Liu*
1
,
Zitao Wang*
1
,
Ronghui Zhu
,
Feiyan Wang
,
Yanxiang Cheng
,
Yeqiang Liu
1
Department of Obstetrics and Gynecology
,
Renmin Hospital of Wuhan University
,
2
Department of Pathology, Shanghai Skin Disease Hospital
,
Tongji University School of Medicine
Capitoli
00:08
Introduction
01:54
I. Download and preprocess the data
05:12
II. RNA‐seq differential expression analysis through “limma”
08:53
III. RNA‐seq differential expression analysis through
“edgeR”
11:34
IV. RNA‐seq differential expression analysis through “DESeq2”
13:51
V. Venn diagram
14:36
Conclusion
Summary
Traduzione automatica
English (Original)
العربية (Arabic)
中文 (Chinese)
Nederlands (Dutch)
français (French)
Deutsch (German)
עברית (Hebrew)
italiano (Italian)
日本語 (Japanese)
한국어 (Korean)
português (Portuguese)
русский (Russian)
español (Spanish)
Türkçe (Turkish)
Traduzione automatica
פרוטוקול מפורט של שיטות ניתוח ביטוי דיפרנציאלי עבור רצף RNA סופק: לימה, EdgeR, DESeq2.
Tags
RNA Sequencing
Differential Expression Analysis
Limma
EdgeR
DESeq2
Cholangiocarcinoma
Cancer
Gene Expression
Ensemble Gene ID
Gene Symbol
Low-expressed Genes
Design Matrix
DGEList
Normalization
Linear Model
T-statistic
F-statistic
Log-odds
Log2 Fold Change
FDR
Article
Embed
AGGIUNGI ALLA PLAYLIST
Usage Statistics
Video correlati
שימוש-רצף RNA כדי זיהוי וריאנטים אחוי Novel הקשורות עמידות לתרופות ב<em> במבחנה</em> מודלי סרטן
אלקטרופורזה דו-ממדית בג'ל בשילוב עם שיטות ספקטרומטר מסה על ניתוח של רקמת גידול בבלוטת יותרת המוח האנושי פרוטאום
עצם תלת-ממדי מטריצה חוץ-תאית מודל אוסטאוסרקומה
רצפי RNA קטן ללא קידוד מתוך פורמאלין-רקמות קבועות וסרום-אקסוזומים נגזרות מחולי סרטן הערמונית עמידים סירוס
הערכת מוות תאים באמצעות Supernatant ללא תאים של פרוביוטיקה בתרביות כדוריות תלת מימדיות של תאים סרטניים המעי הגס
תסיסה אוטומטית של כתמים גרעיניים דיפרנציאליים לקביעה מדויקת של ציטוקוקסיות מיטוקאן
פרוטוקול דיסקציה אוטומטי להעשרת גידולים ברקמות בעלות תכולת גידול נמוכה
פרופיל מרחבי של ביטוי חלבונים ורנ"א ברקמות: גישה לכוונון עדין של מיקרו-דיסקציה וירטואלית
מתווך פוספוליפידים המושרה טרנספורמציה בתרבויות תלת מימדיות
יצירת ציבריד טרנסוכונדריאלי באמצעות קווי תאים סרטניים
Read Article