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Identification d’un épissage alternatif et d’une polyadénylation dans les données de séquençage de l’ARN
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Identification of Alternative Splicing and Polyadenylation in RNA-seq Data
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Identification d’un épissage alternatif et d’une polyadénylation dans les données de séquençage de l’ARN

DOI:
10.3791/62636-v

•

08:35 min

•

June 24, 2021

•

, , ,
1Department of Genome Sciences, The John Curtin School of Medical Research,The Australian National University, 2Department of Biology,New York University

Capitoli

  • 00:05Introduction
  • 00:51Alternative Splicing (AS) Analysis Using RNA-Seq
  • 06:02Results: Alternative Splicing and Polyadenylation in RNA-Seq Data
  • 07:46Conclusion

Summary

Traduzione automatica

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L’épissage alternatif (AS) et la polyadénylation alternative (APA) élargissent la diversité des isoformes de transcrits et de leurs produits. Ici, nous décrivons des protocoles bioinformatiques pour analyser les tests de séquençage d’ARN en vrac et de séquençage à 3' pour détecter et visualiser l’AS et l’APA variant selon les conditions expérimentales.

Tags

Alternative SplicingPolyadenylationRNA-seqDifferential SplicingDifferential Exon ExpressionLimmaEdgeRVoomDiffSplice

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