Rivista
/
Biologia
/
Identificazione di splicing alternativo e poliadenilazione in dati di RNA-seq
JoVE Journal
Biologia
È necessario avere un abbonamento a JoVE per visualizzare questo.  Accedi o inizia la tua prova gratuita.
JoVE Journal Biologia
Identification of Alternative Splicing and Polyadenylation in RNA-seq Data
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

Identificazione di splicing alternativo e poliadenilazione in dati di RNA-seq

DOI:
10.3791/62636-v

•

08:35 min

•

June 24, 2021

•

, , ,
1Department of Genome Sciences, The John Curtin School of Medical Research,The Australian National University, 2Department of Biology,New York University

Capitoli

  • 00:05Introduction
  • 00:51Alternative Splicing (AS) Analysis Using RNA-Seq
  • 06:02Results: Alternative Splicing and Polyadenylation in RNA-Seq Data
  • 07:46Conclusion

Summary

Traduzione automatica

Traduzione automatica

Lo splicing alternativo (AS) e la poliadenilazione alternativa (APA) espandono la diversità delle isoforme di trascrizione e dei loro prodotti. Qui, descriviamo i protocolli bioinformatici per analizzare i saggi di sequenziamento di massa dell'RNA-seq e 3' per rilevare e visualizzare AS e APA che variano in base alle condizioni sperimentali.

Tags

Alternative SplicingPolyadenylationRNA-seqDifferential SplicingDifferential Exon ExpressionLimmaEdgeRVoomDiffSplice

Article

Embed

AGGIUNGI ALLA PLAYLIST

Usage Statistics

Video correlati

RNA-seq Analisi trascrittomi in trombina-trattati e di controllo dell'uomo polmonari cellule endoteliali microvascolari

L'esaurimento delle RNA ribosomiale per metagenomiche Gut Mosquito RNA-seq

Le colture per pluripotenti umane alternative staminali produzione di celle, manutenzione e analisi genetica

Rilevamento di splicing alternativo Durante epiteliale-mesenchimale transizione

Un Sperimentale e Bioinformatica Protocollo per analisi di RNA-Seq di photoperiodic diapausa nella zanzara tigre,<em> Aedes albopictus</em

Rapida identificazione dei chimici genetici Interactions in<em> Saccharomyces cerevisiae</em

I metodi per scoprire alternative Uso Promotore e regolazione trascrizionale di Murine Bcrp1

Identificazione di nuovi regolatori della traspirazione vegetale mediante screening termico su larga scala in Helianthus Annuus

Una pipeline bioinformatica per lo studio dell'evoluzione molecolare e dell'espressione genica usando RNA-seq

De novo Identificazione di frame di lettura aperti tradotti attivamente con dati di profilazione dei ribosomi

Read Article