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대규모 다중 오믹스 게놈 전체 연관 연구 (Mo-GWAS) : 샘플 준비 및 정상화에 대한 지침

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Biochimica

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Large-Scale Multi-Omics Genome-Wide Association Studies (Mo-GWAS): Guidelines for Sample Preparation and Normalization

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대규모 다중 오믹스 게놈 전체 연관 연구 (Mo-GWAS) : 샘플 준비 및 정상화에 대한 지침

DOI:

10.3791/62732-v

•

08:27 min

•

July 27, 2021

•

Mustafa Bulut, Alisdair R. Fernie², Saleh Alseekh²

¹Max-Planck-Institute of Molecular Plant Physiology, ²Center of Plant Systems Biology and Biotechnology

Capitoli

00:04Introduction
00:48Preparation of Biological Plant Material
01:57Sample Extraction
03:35UHPLC-MS Analysis of Semi-Polar Metabolites and Normalization of Large-Scale Metabolomics Dataset
05:37Genome-Wide Association Studies (GWAS)
06:26Results: Metabolomics Data Normalization and QTL Visualization
07:45Conclusion

Summary

Traduzione automatica

이 프로토콜에서는 많은 샘플의 효율적이고 빠른 샘플 준비를 결합한 최적화된 워크플로를 제시합니다. 또한, 대사 GWAS 연구의 고처리량 평가를 위한 분석 변형을 줄이기 위한 단계별 가이드를 제공합니다.

Tags

Multi-omics Genome-wide Association Studies Mo-GWAS Sample Preparation Normalization Technical Variation Biological Variance Metabolites Analytical Platform Genotypic Information Phenotypic Information Natural Population Flash Freezing Extraction Centrifugation Solvent Evaporation GCMS UHPLC-MS

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