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JUMPn: un'applicazione semplificata per il clustering di co-espressione proteica e l'analisi di rete in proteomica
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Capitoli
- 00:04Introduction
- 01:03Setup of JUMPn Software
- 01:31Demo Run Using an Example Dataset
- 06:04Results: Workflow of JUMPn Software and the Protein-Protein Interaction Database
- 07:00Conclusion
Presentiamo uno strumento di biologia dei sistemi JUMPn per eseguire e visualizzare l'analisi di rete per i dati quantitativi di proteomica, con un protocollo dettagliato che include la pre-elaborazione dei dati, il clustering di co-espressione, l'arricchimento del percorso e l'analisi della rete di interazione proteina-proteina.
Tags
Keywords:
Protein Co-expressionClusteringNetwork AnalysisProteomicsJUMPn SoftwareCo-expression ClusteringPathway EnrichmentPPI Module DetectionUser-friendly InterfaceInteractive VisualizationPhosphoproteomicsInteractome DataWGCNA AlgorithmCo-expression PatternsTrends PlotPathway Ontology Enrichment Heatmap
