Inherent Dynamics Visualizer, an Interactive Application for Evaluating and Visualizing Outputs from a Gene Regulatory Network Inference Pipeline

Robert C. Moseley; Sophia Campione; Bree Cummins; Francis Motta; Steven B. Haase

doi:10.3791/63084

Rivista

/

Biologia

/

Visualizer דינמיקה אינהרנטית, יישום אינטראקטיבי להערכה והדמיה של יציאות מצינור הסקת רשת רגולטורית גנטית

JoVE Journal
Biologia

È necessario avere un abbonamento a JoVE per visualizzare questo. Accedi o inizia la tua prova gratuita.

JoVE Journal Biologia

Inherent Dynamics Visualizer, an Interactive Application for Evaluating and Visualizing Outputs from a Gene Regulatory Network Inference Pipeline

Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

Visualizer דינמיקה אינהרנטית, יישום אינטראקטיבי להערכה והדמיה של יציאות מצינור הסקת רשת רגולטורית גנטית

DOI:

10.3791/63084-v

•

10:44 min

•

December 07, 2021

•

Robert C. Moseley, Sophia Campione, Bree Cummins, Francis Motta, Steven B. Haase

¹Department of Biology,Duke University, ²Department of Mathematical Sciences,Montana State University, ³Department of Mathematical Sciences,Florida Atlantic University

Capitoli

00:04Introduction
00:46Node Finding
03:40Edge Finding
05:32Network Finding
08:14Results: Investigating the Core Oscillator Gene Regulatory Network of the Yeast Cell-Cycle
10:06Conclusion

Summary

Traduzione automatica

Visualizer Dynamics Inherent היא חבילת ויזואליזציה אינטראקטיבית המתחברת לכלי הסקת רשת רגולטורית גנטית ליצירה משופרת ויעילה של מודלי רשת פונקציונליים. visualizer יכול לשמש כדי לקבל החלטות מושכלות יותר עבור parameterizing כלי ההסקה, ובכך להגביר את האמון במודלים המתקבלים.

Article

Embed

AGGIUNGI ALLA PLAYLIST

Usage Statistics

Video correlati

רגולציה T תאים: הפוטנציאל הטיפולי לטיפול דחייה וסוג אני סוכרת

שימוש מונה תא אוטומטי כדי לפשט את הביטוי מחקרים ג'ין: siRNA מציאה הביטוי IL 4-Gene תלויים תאים Namalwa

השוואה כמותית של Cis-רגולטוריות (Cre) אלמנט פעילות טראנסגנטי תסיסנית melanogaster</em

באמצעות רצף מעצר SecM ככלי לבודד פוליפפטידים כרוכים הריבוזום

לכידה סלקטיבית של 5-hydroxymethylcytosine מהדנ"א הגנומי

צינור מהיר ואמין למחקר בקטריאלי transcriptome ניתוח מקרה: ויסות גני Serine תלויה ב<em> Streptococcus pneumoniae</em

חזותי תדר Stromule עם מיקרוסקופ פלואורסצנטי

שיטה פשוטה עבור בידוד של סויה Protoplasts, ליישום ניתוחים ביטוי גנים ארעית

הדמיה אופטית מבוססת פוטודיודה להקלטת דינמיקה ברשת עם רזולוציית נוירון יחיד בבלתי חוליות לא מהונדסים

צינור ביואינפורמטיקה לחקירת אבולוציה מולקולרית וביטוי גנים באמצעות RNA-seq