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Shotgun Proteomics Probenverarbeitung automatisiert durch einen Open-Source-Laborroboter
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Capitoli
- 00:04Introduction
- 00:40Mass Spectrometry (MS) Sample Preparation with a Single Protein
- 04:44Peptide Clean-up Using SP3 Paramagnetic Beads
- 06:19MS Sample Preparation with Protein Lysate
- 08:37Results: Mass Spectrometry Proteomics with a Single Protein Standard Bovine Serum Albumin and a Detergent-Containing Human Heart Lysate Sample
- 09:44Conclusion
Detailliertes Protokoll und drei Python-Skripte werden für den Betrieb eines Open-Source-Roboter-Liquid-Handling-Systems bereitgestellt, um eine halbautomatische Proteinprobenvorbereitung für Massenspektrometrie-Experimente durchzuführen, die die Entfernung von Reinigungsmitteln, die Proteinverdauung und die Peptidentsalzungsschritte abdecken.
