Vi præsenterer processen med at isolere, formere og karakterisere kulbrintenedbrydende bakterier fra akvatiske levesteder. Protokollen skitserer bakteriel isolering, identifikation ved 16S rRNA-metoden og test af deres carbonhydridnedbrydende potentiale. Denne artikel vil hjælpe forskere med at karakterisere mikrobiel biodiversitet i miljøprøver og specifikt screene for mikrober med bioremedieringspotentiale.