Rivista
/
Biochimica
/
Modellering av et enzymaktivt nettsted ved hjelp av molekylær visualisering Freeware
JoVE Journal
Biochimica
Author Produced
This content is Free Access.
JoVE Journal Biochimica
Modeling an Enzyme Active Site using Molecular Visualization Freeware

Modellering av et enzymaktivt nettsted ved hjelp av molekylær visualisering Freeware

DOI:
10.3791/63170-v

•

14:37 min

•

December 25, 2021

•

, , , , ,
1The University of Texas at Austin, 2Mount Mary University, 3College of St. Benedict/St. John’s University, 4Wabash College

Capitoli

  • 00:05Introduction
  • 01:42Protocol: UCSF ChimeraX
  • 03:14Results: UCSF ChimeraX
  • 03:33iCN3D Protocol
  • 06:38Results: iCN3D
  • 07:02Protocol: Jmol
  • 09:47Results: Jmol
  • 10:08Protocol: PyMOL
  • 12:56Results: PyMOL
  • 14:01Conclusion

Summary

Traduzione automatica

Traduzione automatica

En viktig ferdighet i biomolekylær modellering er å vise og kommentere aktive steder i proteiner. Denne teknikken er demonstrert ved hjelp av fire populære gratis programmer for makromolekylær visualisering: iCn3D, Jmol, PyMOL og UCSF ChimeraX.

Tags

Molecular VisualizationEnzyme Active SiteGlucokinasePDBID 3FGULigandsSubstrate AnalogCatalytic ComplexBinding InteractionsUCSF ChimeraXMolecular ModelingBiological MacromoleculesVisualization Software

Article

Embed

AGGIUNGI ALLA PLAYLIST

Usage Statistics

Video correlati

check_url/it/63170?article_type=v&slug=modeling-an-enzyme-active-site-using-molecular-visualization-freeware

Kartlegging av bindingssetet på en Aptamer på ATP Bruke mikro termodiffusjon
check_url/it/63170?article_type=v&slug=modeling-an-enzyme-active-site-using-molecular-visualization-freeware

Oligopeptidkonkurranseanalyse for fosforyleringsstedbestemmelse
check_url/it/63170?article_type=v&slug=modeling-an-enzyme-active-site-using-molecular-visualization-freeware

Nettstedet-rettet mutagenese for In Vitro og Vivo eksperimenter eksemplifisert med RNA samhandling i Escherichia Coli
check_url/it/63170?article_type=v&slug=modeling-an-enzyme-active-site-using-molecular-visualization-freeware

Fluorescerende visualisering av mango-Tagged RNA i polyakrylamid gels via en Poststaining metode
check_url/it/63170?article_type=v&slug=modeling-an-enzyme-active-site-using-molecular-visualization-freeware

Uttrykk, rensing, krystallisering, og enzym analyser av Fumarylacetoacetate Hydrolase domene-inneholdende proteiner
check_url/it/63170?article_type=v&slug=modeling-an-enzyme-active-site-using-molecular-visualization-freeware

Evaluering av protein-protein interaksjoner ved hjelp av en on-membran fordøyelsen Technique
check_url/it/63170?article_type=v&slug=modeling-an-enzyme-active-site-using-molecular-visualization-freeware

Karakterisering på Molecular Level bruker robust biokjemiske tilnærminger av en ny kinase protein
check_url/it/63170?article_type=v&slug=modeling-an-enzyme-active-site-using-molecular-visualization-freeware

Enkeltcelleanalyse av transkripsjonsaktive alleler av enkeltmolekyl fisk
check_url/it/63170?article_type=v&slug=modeling-an-enzyme-active-site-using-molecular-visualization-freeware

Stedsspesifikk lysinacetylering av histoner for nukleosomrekonstituering ved bruk av genetisk kodeutvidelse i Escherichia coli
check_url/it/63170?article_type=v&slug=modeling-an-enzyme-active-site-using-molecular-visualization-freeware

Samtidig visualisering av dynamikken i krysskoblede og enkle mikrotubuler in vitro av TIRF mikroskopi

Read Article