यहां प्रोटोकॉल दो प्रजातियों के लिए जड़ों में आर्बसकुलर माइकोराइजल औपनिवेशीकरण पैटर्न और रणनीति के आकलन के तरीकों का वर्णन करता है: ज़िया मेस और फेस्टुका रूबरा। माइकोपैट विधि का उपयोग मापदंडों की गणना, माइकोराइजल संरचनाओं को डिजिटल डेटा में बदलने और जड़ों में उनकी वास्तविक स्थिति के मानचित्रण की अनुमति देता है।