00:56Developing and Running a SeqAPASS Query: Level 1
02:43Developing and Running a SeqAPASS Query: Level 2
03:47Accessing and Understanding the Data: SeqAPASS Level 1 and Level 2
05:54Manipulating Data Settings and Visualizing the Data: SeqAPASS Level 1 and Level 2
07:23Developing and Running a SeqAPASS Analysis: Level 3
08:28Identify Critical Amino Acid Residues through a Literature Search
10:54Visualizing Level 3 SeqAPASS Data and Interpretation of Results
13:45Results: SeqAPASS Level 1, 2, and 3 Analyses of the Conservation of Amino Acid Residues and Level 1 and 2 Analyses of μ Opioid Receptor Conservation Across Taxonomic Groups
Hier presenteren we een protocol om de nieuwste versie van de Sequence Alignment to Predict Across Species Susceptibility (SeqAPASS) -tool van het Amerikaanse Environmental Protection Agency te gebruiken. Dit protocol demonstreert de toepassing van de online tool om snel eiwitbehoud te analyseren en aanpasbare en gemakkelijk interpreteerbare voorspellingen van chemische gevoeligheid tussen soorten te bieden.