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跨长度尺度捕获染色体构象
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Genetica
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JoVE Journal
Genetica
Capturing Chromosome Conformation Across Length Scales
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跨长度尺度捕获染色体构象
DOI:
10.3791/64001-v
•
10:15 min
•
January 20, 2023
•
Liyan Yang
,
Betul Akgol Oksuz
,
Job Dekker
2
,
Johan Harmen Gibcus
1
Department of Systems Biology
,
University of Massachusetts Medical School
,
2
Howard Hughes Medical Institute
Capitoli
00:04
Introduction
00:45
Fixation by Crosslinking
03:32
Chromosome Conformation Capture
08:22
Results: Three‐Dimensional Chromatin Interactions Detection
09:44
Conclusion
Summary
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Hi-C 3.0 是一种改进的 Hi-C 方案,它将甲醛和二琥珀酰亚胺戊二酸酯交联剂与 DpnII 和 DdeI 限制性内切酶的混合物相结合,以提高信噪比和染色质相互作用检测的分辨率。
Tags
Chromosome Conformation
DNA
Chromatin
Cross-linking
Restriction Endonucleases
Ligation
Library Preparation
Hi-C
3C
4C
5C
Sequencing
Genome
Protocol
DSG
Formaldehyde
Glycine
Cell Culture
Centrifugation
Fixation
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