En neuronal lysosom nærhetsmerking proteomikkprotokoll er beskrevet her for å karakterisere det dynamiske lysosomale mikromiljøet i humaninduserte pluripotente stamcelleavledede nevroner. Lysosomale membranproteiner og proteiner som interagerer med lysosomer (stabilt eller forbigående) kan kvantifiseres nøyaktig i denne metoden med utmerket intracellulær romlig oppløsning i levende humane nevroner.