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분자 모델링 접근법에 의한 Caspase 돌연변이 및 번역 후 변형 탐구

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Exploring Caspase Mutations and Post-Translational Modification by Molecular Modeling Approaches

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분자 모델링 접근법에 의한 Caspase 돌연변이 및 번역 후 변형 탐구

DOI:

10.3791/64206-v

•

05:56 min

•

October 13, 2022

•

Dmitry K. Nilov, Alexey V. Zamaraev, Boris Zhivotovsky³, Gelina S. Kopeina

¹Belozersky Institute of Physicochemical Biology,Lomonosov Moscow State University, ²Faculty of Medicine,Lomonosov Moscow State University, ³Division of Toxicology, Institute of Environmental Medicine,Karolinska Institute

Capitoli

00:04Introduction
01:05System Preparation
02:25Energy Minimization
03:16Heating, Equilibration, and Production Dynamics
04:36Results: Biomolecular Simulation of the Wild-Type Caspase and its Mutant Form
05:27Conclusion

Summary

Traduzione automatica

본 프로토콜은 생체 분자 시뮬레이션 패키지를 사용하고 야생형 카스파제 및 그 돌연변이 형태를 모델링하기 위한 분자 역학(MD) 접근법을 설명합니다. MD 방법은 카스파제 구조의 동적 진화와 돌연변이 또는 번역 후 변형의 잠재적 효과를 평가할 수 있습니다.

Tags

Caspase Post-translational Modification Molecular Modeling Molecular Dynamics Protein Structure Cell Death Amber Energy Minimization Molecular Mechanics

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