Rivista
/
Biochimica
/
Sondare la struttura dell'RNA con profilo mutazionale del dimetilsolfato con sequenziamento in vitro e nelle cellule
JoVE Journal
Biochimica
This content is Free Access.
JoVE Journal Biochimica
Probing RNA Structure with Dimethyl Sulfate Mutational Profiling with Sequencing In Vitro and in Cells
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

Sondare la struttura dell'RNA con profilo mutazionale del dimetilsolfato con sequenziamento in vitro e nelle cellule

DOI:
10.3791/64820-v

•

10:34 min

•

December 09, 2022

•

,
1Department of Microbiology,Harvard Medical School

Capitoli

  • 00:04Introduction
  • 00:36Gene‐Specific In Vitro DMS Modification
  • 02:49Gene‐Specific RT‐PCR of Modified RNA
  • 04:19Whole‐Genome DMS‐MaP Using Virus‐Infected Cells
  • 07:17Analysis of the Sequencing Data
  • 08:12Results: Probing RNA Structure with Dimethyl Sulfate Mutational Profiling and Sequencing
  • 10:00Conclusion

Summary

Traduzione automatica

Traduzione automatica

Il protocollo fornisce istruzioni per modificare l'RNA con dimetilsolfato per esperimenti di profilazione mutazionale. Include il sondaggio in vitro e in vivo con due metodi alternativi di preparazione della libreria.

Tags

Keywords: RNA StructureDMS-MaPSequencingIn VitroIn CellsRNA Structure EnsembleBiological ResearchRefolding BufferDimethyl SulfateBeta-mercaptoethanolSpectrophotometerTGIRTComplementary DNAPCR

Article

Embed

AGGIUNGI ALLA PLAYLIST

Usage Statistics

Video correlati

check_url/it/64820?article_type=v

Scambio risolta in tempo ionizzazione elettrospray idrogeno-deuterio Spettrometria di Massa per lo studio delle proteine ​​Struttura e dinamica
check_url/it/64820?article_type=v

Indagine sulla proteina Sequenza-struttura-dinamica Relazioni con Bio3D-web
check_url/it/64820?article_type=v

Polisoma Profiling nel testicolo di topo, cellule umane e di Leishmania
check_url/it/64820?article_type=v

Caratterizzazione delle glicoproteine con la piega di immunoglobulina mediante cristallografia a raggi x e tecniche biofisiche
check_url/it/64820?article_type=v

La struttura e la dinamica dei nucleosomi usando la formazione immagine di microscopia di forza atomica di sondaggio
check_url/it/64820?article_type=v

Mutagenesi sito-diretta per In Vitro e In Vivo esperimenti esemplificati con interazioni RNA in Escherichia Coli
check_url/it/64820?article_type=v

Interazioni con e Membrana Permeabilizzazione di mitocondri cerebrali di Amyloid Fibrils
check_url/it/64820?article_type=v

Etichettatura metabolica estremamente rapida e specifica dell'RNA In Vivo con 4-Thiouracil (Ers4tU)
check_url/it/64820?article_type=v

Estrazione rapida ed economica dell'RNA del tessuto pancreatico ratto
check_url/it/64820?article_type=v

Strategia fosfoproteomica per la profilazione del segnale di stress osmotico in Arabidopsis

Read Article