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TACI: An ImageJ Plugin for 3D Calcium Imaging Analysis

TACI: Um plugin ImageJ para análise de imagem de cálcio 3D

DOI:
10.3791/64953-v

•

09:39 min

•

December 16, 2022

•

, , , , ,
1School of Neuroscience,Virginia Polytechnic Institute and State University, 2CMU-Pitt Joint Computational Biology, School of Medicine,University of Pittsburgh, 3Eastern Virginia Medical School, 4Department of Physics,University of Miami

Capitoli

  • 00:05Introduction
  • 00:33Calcium Imaging
  • 01:38Analysis of 3D Calcium Imaging Data by TACI
  • 07:29Results: Using TACI to Analyze 3D Calcium Imaging
  • 08:48Conclusion

Summary

Traduzione automatica

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TrackMate Analysis of Calcium Imaging (TACI) é um plugin ImageJ de código aberto para análise de imagem de cálcio 3D que examina o movimento no eixo z e identifica o valor máximo de cada z-stack para representar a intensidade de uma célula no ponto de tempo correspondente. Pode separar neurônios sobrepostos na direção lateral (x / y), mas em diferentes planos z.

Tags

3D Calcium ImagingImageJ PluginTACIMotion CorrectionZ-driftTemperature RecordingPeltierTIFF File RenamingTIFF File Organizing

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