/

/

A Comprehensive Approach to Studying the Promoter Interactome in Scarce Cells

/

Интегрированный рабочий процесс для изучения промоторно-ориентированной пространственно-временной архитектуры генома в дефицитных клеточных популяциях

JoVE Journal
Genetica

È necessario avere un abbonamento a JoVE per visualizzare questo. Accedi o inizia la tua prova gratuita.

JoVE Journal Genetica

An Integrated Workflow to Study the Promoter-Centric Spatio-Temporal Genome Architecture in Scarce Cell Populations

Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

Интегрированный рабочий процесс для изучения промоторно-ориентированной пространственно-временной архитектуры генома в дефицитных клеточных популяциях

A Comprehensive Approach to Studying the Promoter Interactome in Scarce Cells

DOI:

10.3791/65316-v

•

01:54 min

•

April 21, 2023

•

Llorenç Rovirosa*¹, Laureano Tomás-Daza*^1,2, Blanca Urmeneta, Alfonso Valencia³, Biola M. Javierre⁴

¹Josep Carreras Leukaemia Research Institute, ²Barcelona Supercomputing Center, ³Catalan Institution for Research and Advanced Studies (ICREA), ⁴Institute for Health Science Research Germans Trias i Pujol

Tags

Keywords: LiCHi-C Chromatin Interactions Genome Organization Gene Regulation Regulatory Elements Promoter-centric Spatiotemporal Rare Cell Populations Low Input Capture Hi-C

Embed

AGGIUNGI ALLA PLAYLIST

Usage Statistics

Video correlati

Интегрированный рабочий процесс для изучения промоторно-ориентированной пространственно-временной архитектуры генома в дефицитных клеточных популяциях

Лизис и переваривание дефицитных клеток

Лигирование и декросслинкинг дефицитной клеточной ДНК

Обработка ультразвуком и вытягивание биотина из ДНК дефицитных клеток

dATP-хвост, лигирование адаптера и ПЦР-амплификация дефицитной клеточной ДНК

Захват библиотеки, вытягивание биотина и амплификация ПЦР с использованием библиотеки ДНК дефицитных клеток

Read Article