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Transferts quotidiens, archivage des populations et mesure de la valeur adaptative dans l’expérience d’évolution à long terme avec Escherichia coli

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Daily Transfers, Archiving Populations, and Measuring Fitness in the Long-Term Evolution Experiment with Escherichia coli

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Transferts quotidiens, archivage des populations et mesure de la valeur adaptative dans l’expérience d’évolution à long terme avec Escherichia coli

DOI:

10.3791/65342-v

•

15:00 min

•

August 18, 2023

•

Jeffrey E. Barrick², Zachary D. Blount³, Devin M. Lake⁴, Jack H. Dwenger, Jesus E. Chavarria-Palma, Minako Izutsu³, Michael J. Wiser⁵

¹Department of Molecular Biosciences,The University of Texas at Austin, ²BEACON Center for the Study of Evolution in Action,Michigan State University, ³Department of Microbiology and Molecular Genetics,Michigan State University, ⁴Department of Integrative Biology,Michigan State University, ⁵Biological Sciences Program,Michigan State University

Capitoli

00:03Introduction
02:02Daily Transfers of LTEE Populations
06:04Competitive Fitness Assays
06:44Prepare Supplies
08:24Day -2: Revive Competitors
09:09Day -1: Precondition Competitors
09:47Day 0: Begin Competition
11:16Alternative:Continue Three-Day Competition
11:43Day 1 or 3: Finish Competition
12:41Calculate and Plot Fitness
12:52Representative Results Appearance and turbidity of LTEE Cultures
13:22Representative Results Co-culture Competition Results
14:39Conclusion

Summary

Traduzione automatica

Ce protocole décrit comment maintenir l’expérience d’évolution à long terme d’Escherichia coli (LTEE) en effectuant ses transferts quotidiens et ses gels périodiques et comment mener des tests de compétition pour mesurer les améliorations de la condition physique chez les bactéries évoluées. Ces procédures peuvent servir de modèle aux chercheurs qui commencent leurs propres expériences d’évolution microbienne.

Tags

Keywords: Daily Transfers Archiving Fitness Measurement Long-term Evolution Experiment Escherichia Coli Glucose-limited Medium REL606 REL607 Ara+Ara-Colony Color Co-culture Competition Assays Relative Fitness

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