Nuclei Isolation from Mouse Cardiac Progenitor Cells for Epigenome and Gene Expression Profiling at Single-Cell Resolution

Stephanie Ibrahim; Catherine Robert; Camille Humbert; Clotilde Ferreira; Gwena&#235;lle Collod; Sonia Stefanovic

doi:10.3791/65328

Nuclei Isolation from Mouse Cardiac Progenitor Cells at Single-Cell Resolution

May 12, 2023

בידוד גרעינים מתאי אב לבביים של עכברים עבור אפיגנום ופרופיל ביטוי גנים ברזולוציה של תא בודד

01:46 min

•

עכבר לב אב בידוד תאים, עיכול, והקפאה

02:43 min

•

הפשרת תאי לב עובריים והסרת תאים מתים

04:22 min

•

בידוד גרעינים מתאי אב לבביים

01:45 min

•

Stephanie Ibrahim, Catherine Robert, Camille Humbert, Clotilde Ferreira, Gwenaëlle Collod, Sonia Stefanovic

¹Center for Cardiovascular Disease & Nutrition, U1263,Aix-Marseille University, ²Marseille Medical Genetics, U1251,Aix-Marseille University

Summary

כאן אנו מציגים פרוטוקול המתאר הכנת גרעיני תאים. לאחר מיקרודיסקציה ודיסוציאציה אנזימטית של רקמת הלב לתאים בודדים, תאי האב הוקפאו, ולאחר מכן בידוד של תאים טהורים בני קיימא, ששימשו לריצוף RNA של גרעין יחיד ובדיקת גרעין יחיד לכרומטין נגיש לטרנספוזאז עם ניתוחי ריצוף בתפוקה גבוהה.