כדי לחקור את תהליכי ההתפתחות של ascospores ב Gibberella zeae, נוהל איסוף בתנאים סטריליים מצולם על מנת להפיק את הרמה הגבוהה ביותר של מידע עבור תיאור פרוטוקול. זה אמור להקל על שחזור של הניסוי, היבט חיוני כאשר ביטוי מלא הגנום בדיקות פרופיל מיושמים.
Abstract
Fusarium graminearum שוובה (teleomorph Gibberella zeae) הוא צמח הפתוגן גורם המחלה גלד על חיטה ושעורה המפחיתה להניב יבול ואיכות תבואה. פ graminearum גם גורם גבעול והאוזן נרקב של תירס הוא מפיק של mycotoxins כגון trichothecenes כי לזהם תבואה מזיקים לבני אדם ובעלי חיים (ו Kistler Goswami, 2004). הפטרייה מייצרת שני סוגים של נבגים. Ascospores, propagules הנובע רבייה מינית, הן המקור העיקרי של הזיהום העיקרי. נבגים אלה הם משוחררים בכוח perithecia בוגרת מפוזר על ידי הרוח (Francl et al 1999). זיהומים משניים נגרמים בעיקר על ידי macroconidia אשר מיוצרים באמצעות מינית על פני הצמח. כדי לחקור את תהליכי ההתפתחות של ascospores ב פטרייה זו, נוהל איסוף שלהם כמות גדולה בתנאים סטריליים נדרש. פרוטוקול שלנו צולם על מנת להפיק את הרמה הגבוהה ביותר של מידע על ההבנה ועל שחזור; היבטים מכריעים כאשר הגן מלא הגנום פרופילי הביטוי נוצרות ולפרש. בפרט, השתנות של נביטה ascospore והפעילות הביולוגית תלויים מניפולציה מראש של החומר. השימוש וידאו המתעדים כל צעד בייצור ascospore מוצע על מנת להגביר את הסטנדרטיזציה, העומד בדרישות המחמירות לניתוח microarray. ההליך דורש רק ציוד מעבדה סטנדרטי. השלבים מוצגים על מנת למנוע זיהום זמן לטובת סינכרון של ascospores.
Protocol
אגר גזר (Klittich ולסלי, 1988) הוכן 9 ס"מ קוטר צלחות פטרי. קוביה 2 מ"מ של אגר המכיל תפטיר טרי גדל על אגר דקסטרוז תפוחי אדמה יושמה למרכז צלחת פטרי כל. תרבויות גדלו במהירות של 25 ° C ו -12 שעות photoperiod עבור 96 שעות. …
Discussion
הפרוטוקול המובא כאן מתבסס על ההליכים הקודמים המשמש לייצור perithecial עבור Fusarium spp. (Klittich ולסלי, 1988; שביל משותף, 2000). התקינה של ההליך שבו כמויות גדולות של ascospores (מספיק לצורך ניתוח microarray) נוצרו היה חיוני עבור שחזור של הניסוי. זה כבר דווח כי ההבדלים גורמים סביבתיים, גיל המצע יכול לשנות את א?…
Acknowledgements
המחברים מודים קארן הילברן לקבלת תמיכה טכנית מעולה. פרויקט זה מומן על ידי היוזמה הלאומית למחקר של החינוך שיתופית USDA המחקר, המדינה שירות ההדרכה והמקצוע (פרס # 2004-35604-14327). מטיאס Pasquali נתמך על ידי ברנקו וייס המלגה. חיטה ארה"ב גלד יוזמת ברלי הוא גם הודה על התמיכה המתמשכת של המחקר.
Materials
Material Name
Type
Company
Catalogue Number
Comment
Petri dish 9 cm Diameter
Tool
Tween 60 (20%)
Reagent
Carrot agar (20% w/v organic carrots and 1.5% w/v agar)
Beyer, M., Verreet, J. A., Francl, L., Shaner, G., Bergstrom, G., Gilbert, J., Pedersen, W., Dill-Macky, R., Sweets, L., Corwin, B., Jin, Y., Gallenberg, D., Wiersma, J., Goswami, R. S., Kistler, H. C., Klittich, C. J. R., Leslie, J. F., Trail, F., Common, R., Tschantz, A. T., Horst, R. L., Nelson, P. E., Tschanz, A. T., Horst, R. K., Nelson, P. E. Germination of Gibberella zeae ascospores as affected by age of spores after discharge and environmental factors.유전학. 118, 417-2013 (2005).
Pasquali, M., Kistler, C. Gibberella zeae Ascospore Production and Collection for Microarray Experiments.. J. Vis. Exp. (1), e115, doi:10.3791/115 (2006).