Большой объем (20 л +) Фильтрация прибрежной морской воды Образцы
Summary
Это видео документов большого объема (≥ 20 л) фильтрация микробной биомассы, в диапазоне между 0.22μm и 2.7μm в диаметре, из толщи воды.
Abstract
Рабочий процесс начинается со сбора прибрежные морские воды ниже по течению микробного сообщества, питательных веществ и следов анализ газа. Для этого метода образцы были собраны с палубы HMS Джон Стрикленд, работающих в Саанич входе. Это видео документов большого объема (≥ 20 л) фильтрация микробной биомассы, в диапазоне между 0.22μm и 2.7μm в диаметре, из толщи воды. Два 20L образцы могут быть отфильтрованы одновременно, используя один насосный агрегат оснащен четырьмя вращающимися головками. Фильтрация осуществляется в поле на расширенной поездки, или сразу после возвращения для однодневных поездок. Важно, чтобы записать количество воды, проходящей через каждую единицу sterivex фильтр. Чтобы предотвратить образование биопленки между выборки поездки, все оборудование для фильтрации следует промыть разбавленным HCl и деионизированной воды и автоклавного сразу после использования. Эта процедура займет около 5 часов плюс дополнительный час для очистки.
Protocol
Discussion
Крайне важно, чтобы протереть скамейки и насосы с мокрым полотенцем после использования, чтобы удалить любые вялые следы соленой воды, которые могли бы коррозии оборудования. Хотя процедура проста, время требование может быть обширным в зависимости от концентрации биомассы или мусора…
Disclosures
The authors have nothing to disclose.
Acknowledgements
Мы хотели бы поблагодарить Канадский фонд инноваций, знаний британской Колумбии Фонд развития и Национального наукам и инженерным исследованиям Совета (NSERC) Канады за поддержку проводимых исследований на регионах с низким уровнем кислорода в прибрежных и открытых водах океана. ОУПЖ была поддержана стипендии NSERC, Киллам и ТУЛА основу финансируемого Центром микробного разнообразия и эволюции.
Materials
| Material Name | Type | Company | Catalogue Number | Comment |
|---|---|---|---|---|
| Peristaltic pump | Masterflex (Cole Palmer) | 77913-20, 77200-62, 77200-04 | ||
| Tygon LFL tubing | Masterflex (Cole Palmer) | 06429-24 | For filtration apparatus | |
| Hose clamps | Cole Palmer | 0683204 | For filtration apparatus | |
| 1/4” x 3/16” pipe adaptors | Cole Palmer | 31702-20 | For filtration apparatus | |
| Polypropylene prefilter housing | ADVANTEC | 501200 | For filtration apparatus | |
| Metal luer fitting (Hose end to Male luer lock) | Cole Palmer | 31507-27 | For filtration apparatus | |
| 2“ Magnets | For filtration apparatus | |||
| 3 port carboy caps | For filtration apparatus | |||
| GV 0.22 μm STERIVIX filters | Millipore | SVGV01R5 | ||
| 47 mm diameter 2.7 μm GF/D filters | Whatman | 1823047 | ||
| Lysis buffer | Reagent | 0.75 M sucrose, 40 mM EDTA, 50 mM Tris (pH 8.3) | ||
| 0.1 % HCl | Reagent | For post-filtration rinse | ||
| Autoclaved water | Reagent | For post-filtration rinse |
