沿岸海水サンプルの大容量（20L +）ろ過
Summary
このビデオ、ドキュメント、大容量（≥20リットル）の水のカラムから、直径0.22μmと2.7μmの範囲の微生物バイオマスのろ過、、。
Abstract
ワークフローは、下流の微生物群集のための沿岸海域、栄養素と微量ガス分析の収集から始まります。この方法の場合、サンプルはサーニッチのインレットでHMSジョンストリックランドの動作のデッキから採取された。このビデオ、ドキュメント、大容量（≥20リットル）の水のカラムから、直径0.22μmと2.7μmの範囲の微生物バイオマスのろ過、、。二つの20Lのサンプルは、4つの回転ヘッドを搭載した単一のポンプユニットを使用して同時にフィルタリングすることができます。ろ過は、拡張出張、または直後の日帰り旅行の戻り時にフィールドで行われます。各sterivexフィルタユニットを通過する水の量を記録することが重要です。サンプリングの合間にバイオフィルム形成を防止するために、すべてのろ過装置を希HCl及び脱イオン水で洗浄し、使用後すぐにオートクレーブする必要があります。この手順では、約5時間に加えて、クリーンアップのための追加時間がかかります。
Protocol
Discussion
それ以外の機器を腐食させるという塩水のいずれか残る痕跡を除去するために使用後の湿ったタオルでベンチやポンプを拭うために不可欠です。手順はシンプルですが、時間の要件は、フィルタリングされているサンプルのバイオマスや破片の濃度に応じて豊富なことができます。
Disclosures
The authors have nothing to disclose.
Acknowledgements
我々は、沿岸と外洋水の低酸素領域で進行中の研究を支援するためのイノベーション、ブリティッシュコロンビア州の知識開発基金と国立科学およびカナダの工学研究審議会（NSERC）のためのカナダの財団に感謝の意を表します。 DAWはNSERC、キラムとトゥーラ基礎微生物の多様性と進化のための資金を供給センターからの奨学金によって支えられている。
Materials
| Material Name | Type | Company | Catalogue Number | Comment |
|---|---|---|---|---|
| Peristaltic pump | Masterflex (Cole Palmer) | 77913-20, 77200-62, 77200-04 | ||
| Tygon LFL tubing | Masterflex (Cole Palmer) | 06429-24 | For filtration apparatus | |
| Hose clamps | Cole Palmer | 0683204 | For filtration apparatus | |
| 1/4” x 3/16” pipe adaptors | Cole Palmer | 31702-20 | For filtration apparatus | |
| Polypropylene prefilter housing | ADVANTEC | 501200 | For filtration apparatus | |
| Metal luer fitting (Hose end to Male luer lock) | Cole Palmer | 31507-27 | For filtration apparatus | |
| 2“ Magnets | For filtration apparatus | |||
| 3 port carboy caps | For filtration apparatus | |||
| GV 0.22 μm STERIVIX filters | Millipore | SVGV01R5 | ||
| 47 mm diameter 2.7 μm GF/D filters | Whatman | 1823047 | ||
| Lysis buffer | Reagent | 0.75 M sucrose, 40 mM EDTA, 50 mM Tris (pH 8.3) | ||
| 0.1 % HCl | Reagent | For post-filtration rinse | ||
| Autoclaved water | Reagent | For post-filtration rinse |
