沿海海水样品的过滤体积小（1 - 3L）
Summary
此视频文件体积小（约1升）过滤的微生物生物量的水柱。
Abstract
工作流程开始与下游微生物群落的沿海海域，养分和微量气体分析的集合。对于今天的示范样本收集从甲板HMS施德Saanich入口经营。此视频文件体积小（约1升）过滤的微生物生物量的水柱。该协议是延长大体积取样协议如前所述，一个主要的区别：在这里，有没有预过滤步骤，让所有大小类生物质收集到0.22微米的过滤器切断。样品收集这种方式，是理想的核酸分析。设置，过滤和清理的每个步骤需时约20-30分钟。如果同时使用两个蠕动泵，最多8个样品，同时可过滤。为了防止生物膜之间的采样人次的形成，所有的过滤设备，必须用稀盐酸和去离子水冲洗，高压灭菌后立即使用。
Protocol
设置过滤装置 过滤前，先擦去从满瓶凝露和权衡将泵一侧的高压灭菌器斌，其他废物瓶。 然后将一个完整的样瓶，在蒸压斌;但是，不要删除瓶盖。 通过蠕动泵管，使油管露儿烧瓶中。 使用镊子，取出25毫升无菌吸管棉花，和吸管连接油管的另一端。 海水过滤 要开始过滤海水，打开瓶盖，插入吸管。打开泵和流动速度设置为1?…
Discussion
当务之急是盐水中删除任何挥之不去的痕迹，否则将腐蚀设备后，使用湿毛巾擦拭长椅和泵。虽然过程很简单，时间要求，可广泛取决于生物质的浓度或在被筛选的样本碎片。
Disclosures
The authors have nothing to disclose.
Acknowledgements
我们要感谢支持沿海和公海水域低氧气地区正在进行的研究创新，不列颠哥伦比亚省知识发展基金和国家科学和工程研究理事会（NSERC），加拿大的加拿大基金会。提高妇女地位司的支持由NSERC，Killam和图拉基金会资助的微生物多样性和进化中心奖学金。
Materials
| Material Name | Type | Company | Catalogue Number | Comment |
|---|---|---|---|---|
| Peristaltic pump | Masterflex (Cole Palmer) | 77913-20, 77200-62, 77200-04 | ||
| Tygon LFL tubing | Masterflex (Cole Palmer) | 06429-24 | For filtration apparatus | |
| Hose clamps | Cole Palmer | 0683204 | For filtration apparatus | |
| 1/4” x 3/16” pipe adaptors | Cole Palmer | 31702-20 | For filtration apparatus | |
| Polypropylene prefilter housing | ADVANTEC | 501200 | For filtration apparatus | |
| Metal luer fitting (Hose end to Male luer lock) | Cole Palmer | 31507-27 | For filtration apparatus | |
| 2“ Magnets | For filtration apparatus | |||
| 3 port carboy caps | For filtration apparatus | |||
| GV 0.22 μm STERIVIX filters | Millipore | SVGV01R5 | ||
| 47 mm diameter 2.7 μm GF/D filters | Whatman | 1823047 | ||
| Lysis buffer | 0.75 M sucrose, 40 mM EDTA, 50 mM Tris (pH 8.3) | |||
| 0.1 % HCl | For post-filtration rinse | |||
| Autoclaved water | For post-filtration rinse |
Cite This Article
Walsh, D. A., Zaikova, E., Hallam, S. J. Small Volume (1-3L) Filtration of Coastal Seawater Samples. J. Vis. Exp. (28), e1163, doi:10.3791/1163 (2009).