Vi presenterar en icke-invasiv provtagning sätt att effektivt samla hår prover från gäckande små däggdjur, som visas för den amerikanska pika. Vi visar nyttan av denna metod genom att extrahera DNA från provtagning hår och förstärka flera typer av molekylära markörer används ofta i studier av vilda djur ekologi och bevarande.
Noninvasiv genetisk provtagning angreppssätt blir allt viktigare att studera djurliv. Ett antal studier har rapporterat att använda icke-invasiv provtagningsteknik för att undersöka populationsgenetik och demografi vilda populationer 1. Detta tillvägagångssätt har visat sig vara särskilt användbart när man hanterar sällsynta eller svårfångade arter 2. Även ett antal av dessa metoder har utvecklats för att prova hår, avföring och annat biologiskt material från rovdjur och medelstora däggdjur, de har i stort sett oprövat i svårfångade små däggdjur. I denna video presenterar vi en ny, billig och icke-invasiv hår snara som riktar sig till en gäckande små däggdjur, den amerikanska Pika (Ochotona princeps). Vi beskriver den allmänna uppbyggnaden av håret snara, som består av remsor av förpackningstejpen arrangerade i en web-liknande mode och placeras längs reser rutter i Pikas livsmiljö. Vi illustrerar effektiviteten i snara att samla en stor mängd hår som sedan kan samlas in och föras tillbaka till labbet. Vi visar då användningen av DNA-IQ-system (Promega) isolera DNA och visa nyttan av denna metod för att förstärka vanliga molekylära markörer inklusive kärnvapen mikrosatelliter, förstärkta fragmentet polymorfismer längd (AFLPs), mitokondriella sekvenser (800bp) samt en molekylär könsbestämning markör. Sammantaget visar vi nyttan av denna nya icke-invasiv hår snara som provtagningsteknik för biologer djurlivet befolkning. Vi räknar med att detta tillvägagångssätt kommer att tillämpas på en mängd små däggdjur, öppna områden av undersökning inom naturliga populationer, och samtidigt minimera påverkan för att studera organismer.
Noninvasiv genetisk provtagning har blivit ett attraktivt alternativ till traditionella leva fångstmetoder av flera skäl. Först genom att diskret samla in biologiskt material (t.ex. avföring, hår, fjädrar, saliv och slem) från vilda populationer, kan forskarna studera dessa arter utan att störa, hantering, eller ens observerar dem, vilket minskar riskerna för både djur och forskare. För det andra kan icke-invasiv genetisk provtagning biologer för att studera populationer av svårfångade och sällsynta arter, en uppgift som kan vara svårt med mer traditionella levande fånga metoder 6. Och för det tredje kan NGS öka potentiellt urvalsstorlekar genom att minska störningar för djur, insatser provtagning och kostnader, vilket bidrar till att minska fördomar i uppskattningar av befolkningen parametrar 7. Det sistnämnda kan visa sig avgörande när det handlar om hotade arter, eftersom partisk uppskattningar av befolkningen parametrar kan resultera i olämpliga förvaltningsbeslut.
I det aktuella videon artikeln beskriver vi en enkel, nya, billiga och icke-invasiv metod för att prov gäckande små däggdjur, med hjälp av amerikanska Pika som ett exempel. Vi visar att DNA extraherat från hår presterar på samma sätt som DNA extraherat från levern prover med avseende på mikrosatellit, AFLP, mitokondrie och markörer könsbestämning, vilket gör denna icke-invasiv provtagning ett attraktivt alternativ att bo fångst eller dödande provtagning. Sammantaget räknar vi med att denna metod kommer att vara användbart i insamlingen skede av befolkningen genetiska och beteendevetenskapliga studier av sällsynta eller gäckande små däggdjursarter, och samtidigt minimera påverkan på de organismer som studeras.
The authors have nothing to disclose.
Vi vill tacka L. Evans, B. Granger, D. Rissling, Z. Sim, A. Goodwin, K. Hayhurst och D. Kuch för hjälp i fält. K. Galbreath förutsatt vänligt pika lever prover från Bella Coola dalen. Tack till A. Gonçalves da Silva och K. Larsen för intressanta diskussioner som bidragit till utformningen av denna icke-invasiv genetisk provtagning. Detta arbete har finansierats av naturvetenskaplig och teknisk forskning Council of Canada Discovery, och UBC Okanagan Individuella stipendier forskning till mars En schweizisk National Science Foundation doc PBSKP3_128523 stöds PH. Denna studie har genomförts efter djurvård protokoll från University of British Columbia (Certificate Number: A07-0126).
Hair snare:
DNA extraction: